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[分享] 高效靶向:ERA 基础扩增试剂的性能表征与科研价值挖掘

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发表于 2026-1-21 14:50 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 小书虫 于 2026-1-21 14:51 编辑

《Ultrasensitive, Specific, and Rapid Detection of Mycoplasma pneumoniae Using the ERA/CRISPR–Cas12a Dual System》(影响因子5.2)一文发表于《Frontiers in Microbiology》,由南华大学衡阳医学院团队研发了一种整合酶促重组扩增(ERA)与 CRISPR–Cas12a 技术系统的肺炎支原体新型检测模式。该研究的核心科研价值在于依托ERA技术的高效等温扩增特性,与CRISPR技术的精准识别能力有机结合,完善了精准检测体系,为肺炎支原体在科研应用提供了有力的数据支撑与实践参考。

核心原理技术
该检测体系以ERA高效扩增为核心,采用GenDx Basic ERA Kit(KS101)搭配CRISPR-Cas12a技术形成的检测机制,其中ERA技术展现出快速、高效、稳定的等温扩增能力,为后续CRISPR-Cas12a的高灵敏度与高特异性检测奠定了坚实基础,是实现“30分钟快速检测”的关键一环。

一、工作流程
实验材料:肺炎支原体标准菌株(M129, ATCC 29342)及 9 种对照菌株。
1.核酸提取:参照试剂盒说明书提取各菌株及实验样本的基因组DNA,置于-80℃低温保存备用,确保核酸完整性与稳定性。
2.标准质粒构建:克隆肺炎支原体P1基因269bp保守片段至pUC57载体,构建标准质粒并进行梯度稀释(10⁶~10⁰拷贝/μL),用于后续灵敏度验证实验。
3.ERA快速扩增:分别构建荧光检测体系与试纸条检测体系,以ERA技术参数优化为核心,重点调整ERA引物浓度、反应温度与时间,同时适配优化特异性识别组件浓度,确定兼顾扩增效率与识别准确性的最优反应条件。
4.性能验证:以梯度稀释的标准质粒验证系统灵敏度;以9种对照菌株验证系统特异性;选取92份实验样本(经qPCR验证,56份阳性、36份阴性)进行适用性验证,以qPCR检测结果为金标准,计算阳性预测一致性(PPA)与阴性预测一致性(NPA),评估系统实际应用价值。

二、结论输出
灵敏度:ERA/CRISPR–Cas12a 荧光系统最低检测限达 1 拷贝 /μL,与商用 qPCR 灵敏度相当;试纸条系统最低检测限为 100 拷贝 /μL,满足临床检测需求;
特异性:对 9 种对照菌株均无交叉反应,荧光系统与试纸条系统特异性均为 100%;
临床性能:荧光系统对临床样本的 PPA 和 NPA 均为 100%,与 qPCR 结果完全一致;试纸条系统 PPA 为 92.86%、NPA 为 100%,临床一致性优异;
检测速度:核心依赖ERA技术的快速扩增能力,ERA扩增仅需15分钟,后续特异性验证耗时15~20分钟,核心流程合计仅需30分钟,凸显了ERA等温扩增技术的高效优势。

三、优势
ERA技术具备超灵敏检测/高特异性/快速高效/操作简便等优势,本研究成功构建 “高效扩增 + 精准识别” 的技术整合,有效解决了传统检测技术灵敏度不足、操作复杂、耗时久、场景适配性差等问题。未来将进一步优化ERA试剂稳定性与样本处理流程,拓展其在环境样本、模型样本等场景的应用范围,提升技术转化价值。

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