也有计算单位面积下阳性细胞数的方法。通过统计 20 倍镜下的细胞数,在除以镜下面积,得出细胞密度,单位为 cells/mm2。 三、Image Pro Plus 软件测量平均光密度值
有时,我们想定量的分析某因子的高低表达差异,用半定量的积分制并不能很好的区分差异,我们可使用软件进行统计分析。Image Pro Plus 软件的计量原理是根据目的蛋白的着色深浅及分布面积来确定目的蛋白的表达量。通过测量出每张图片的累积光密度值(integrated option density, IOD)值以及区域面积 area 值,再计算出平均光密度值(mean density)即 mean density=IOD/area,此值反映了目标蛋白的单位面积浓度。最后取每个样本的 5 个随机区域 mean density 的平均值即为此样本的值。下面我们以分析免疫组化图片为例讲解 IPP 软件的操作步骤(假设粉红色未阳性表达区域)。 第一步:处理图像
我们分析的是免疫组化的图片,所以先要把图像 intensity 格式。在默认的 intensity 格式中,是图片灰度,越黑数值越小,越白数值越大。而实际上我们测量的染色强度是光密度,染色越深,光密度值越大。如果不进行光密度单位的转换,测量的数值将完全相反的。 方法:measure - calibration - intensity,然后在窗口中点 new 按钮,再点一下下面的 std optical density 选项,这时可以看到窗口中的直线变成了反向的曲线。
然后点 system - close(IPP 功能多,建议每次都检查,如果中途不再进行别的功能,打开软件后只要操作一次就行,不用每张图片都操作)
第二步:颜色选取
明确一个概念 AOI(area of interest),即感兴趣的区域,也是我们观察的重点,也就是我们说的免疫组化阳性表达区域。这里我只介绍入门级的 2 种选择方法:吸管工具和 HIS 颜色选择系统。
先介绍吸管工具:
点击 measure---count/size,跳出如下界面。