有哪些可以画分子结构或者晶体结构的软件？

奋斗的小鸟

顺便有没有找软件的途径

原文地址：https://www.zhihu.com/question/271097555

长长的路

一、声明

如果您的科研项目需要涉及模拟计算、测试表征、超算服务器或仪器设备等服务，欢迎通过 【ttang2077】了解。 以下是利用公开资源为大家整理的工具教程，希望能在科研路上帮到你。
温馨提示：分享的所有软件，均由互联网中的资源整理所得，仅限学习交流，切勿商用，侵删！
二、软件下载

相关软件下载安装和使用教程请移步“元素魔方科研服务”公众号，公众号将持续更新更多科研领域文章。
[软件名称]：Mercury
[界面语言]：中文/英文
[安装环境]：Win11/Win10/Win9/Win8/Win7
[系统位数]：64位
[软件类型]：观察晶体结构软件
[下载链接]：
安装包链接，解压密码在宫中号【元素魔方科研服务】获取三、软件介绍

Mercury也被称为Hg，是一款功能强大的晶体结构软件。用来观察研究晶体的三维结构，晶体的可视化，及晶体解析，可获取化合物的粉末模拟数据，输出图片、文本数据以及获取晶体学参数等。
四、安装教程

注意事项
①解压安装包和软件安装时，关闭杀毒软件，否则安装文件容易被误删除；②安装软件时，要右击压缩包，把压缩包解压出来，不要直接双击压缩包；③安装包及软件安装路径，最好是英文或数字，如有中文路径，容易报错；
1.对“Mercury”压缩包进行解压
2.打开“mercury”文件夹，右击“mercury”应用程序，以管理员身份运行


3.弹出对话框


4.选择“Activate CSD-Community”，再点击“Activate”


5.显示激活成功，之后弹出的错误窗口直接点击“OK”




6.将“mercury”应用程序发送到桌面


7.双击图标打开软件，点击“Yes”


8.界面如下，安装完成


五、使用教程

Mercury常用功能简介

一、File（文件）

1、Open：打开一个新的cif文件

2、Recent Files：最近打开的文件
3、Save As：保存，可保存的格式有cif、txt、mol、mryx、res、jpg、pdf、png、tif等格式
二、Selection（选择）
1、Select All：选择全部原子
2、Select：选择部分类型原子
Select Hydrogen：选择全部氢原子
Select Non-Hydrogen：选择全部非氢原子
Select Carbons：选择全部碳原子
Select Non-H，C：选择全部非氢非碳原子
Select Meral Atoms：选择全部金属原子
Select Non-Meral Atoms：选择全部非金属原子
3、Deselect All：取消选择全部原子
4、Deselect：取消选择部分类型原子，可以选择氢原子、非氢原子、碳原子、非氢非碳原子、金属原子、非金属原子等
三、Display（显示）
1、Styles：样式
Wireframe：线框图
Stick：棍图
Ball and stick：球棍图
Spacefill：空间填充图
Ellipsoid：椭球图
Polyhedral：多面体图
Stick settings：棍图设置
Ball and Stick settings：球棍图设置
Spacefill settings：空间填充图设置
Ellipsoid settings：椭球图设置
Polyhedral settings：多面体图设置
Contact settings：联系设置
Measurement settings：测量设置
2、Labels：标签
Atoms：原子
Centroids：重心
Planes：平面
Label all：全部标签
Clear all labels：清楚全部标签
Reset label positions：重置标签位置
Label colour：标签颜色
Label size：标签大小
3、Colours（颜色）
Atoms：原子
Bonds：键
Centroids：重心
Planes：平面
Contact：联系
Element colours：元素颜色
Labels：标签
Background settings：背景设置
4、Show/Hide：显示/隐藏
Show hydrogents：显示氢原子
Hide hydrogents：隐藏氢原子
Atoms：原子
Centroids：重心
Planes：平面
Show all：显示全部
5、Dispiay Options：显示选项
6、Manage Styles：管理样式（可以设置自定义样式）
7、View along：查看
8、Toolbars：工具栏
Dispiay Options：显示选项
Graph Sets：图集
Intermolecular Potentials：分子间电位
Searches：搜索
Post Search Options：发布搜索选项
Structure Navigator：结构导航器
Picking Toolbar：选择工具栏
Labels：标签
Dispiay：显示
Style Manager Toolbar：样式管理器工具栏
Atom Selection Toolbar：原子选择工具栏
Select by SMARTS：由SMARTS选择
Animation Toolbar：动画工具栏
Crystal Orientation Operations：晶体定位操作
Alignment and Orientation Operations：对齐和定向操作
四、Calculate（计算）
1、Centroids：重心
2、Planes：平面
3、Packing/Slicing：堆积和切断
4、Contacts：联系
5、Molecular Shell：分子壳
6、Powder Pattern：粉末谱图
五、快捷键
Ctrl+A：全选原子
Ctrl+D：取消选择全部原子
Ctrl+Z：撤销操作
Ctrl+左键：平移
Shift+左键：平面旋转
Alt+左键：圈选原子
左键：任意角度旋转
右键：放大或缩小
软件演示案例，MXene三维晶体结构绘制教程

效果展示


图文教程
1. cif查找，由于方向限制，小编对MXene并不是很清楚，此处为直接在Google scholar 上查找并下载的cif（选择了一个下载），具体如图所示。








2. cif转换，导入mercury软件中，修改相应晶体参数等（这就得根据自身情况了），导出：








3. 导入max进行编辑、修改、赋予材质，简单渲染如下：

继续前进

【第一期】5款全球主流AI及传统化学结构编辑器下载安装大全来啦！
有好多呢，我来总结几个~~
1.Collector
Collector是一款能从专利、文献及各类图片中把化学结构快速提取成与原图呈现形式一致的AI软件，用户可轻松编辑已提取结构的各类理化性质数据，所得结构式和分析结果可随时导出为计算机可读的各类格式(SDF/MOL/SMILES/XLS/PNG)，帮用户解决“画结构式时，耗时长且易出错”、 “批量收集专利或文献中化学结构信息时，耗时长且易漏分析”的难题，辅助科研工作者节省绘制化学结构时间和人力、提高批量处理化学结构数据效率、快速搭建自有数据库。


产品特色
1.免费使用：兼容Win和MacOS操作系统；邮箱/手机号注册为用户后可免费使用一键截图提取+批量提取化学结构功能。
2.极速识别：随时随地轻松提取结构，识别时间仅需1秒钟左右；一次截屏一个结构，一键快速识别结构。
3.批量提取：支持批量提取专利/文献/图片中的结构, 上传文件格式包括jpg/png/pdf，一次性快速提取成千上万个化学结构。
4.准确度高：对于正常截图的化学结构，均可一键识别；分析测试上万个各类化学结构，识别准确度居行业领先水平。
5.实时校正：内置功能齐全的化学编辑器，可实时与原图对照进行校准；支持实时校正识别后的结构，在线校准模式便捷易用。
6.保存格式多样：支持识别后结构的sdf/xls/smiles/png文件格式下载及mol/smiles格式快速一键复制。
7.识别方式多种：同时支持支持OCSR（化学结构识别）和 IUPAC（标准化学名称识别）。
8.定位去重：识别后结构可自动定位至原文件结构位置；自带定位校准模式,对同一结构会去重后展示并标记重复数量和位置。
下载地址：https://www.stonewise.cn/mol_product
2.InDraw
InDraw是一款化学结构式编辑器（Integle ChemistryDraw）软件，由上海鹰谷Integle 公司独立开发，可在主流浏览器上使用，有客户端版和网页版，兼容win7、win8、win10 等操作系统。为科研工作者提供绘制化学结构式、反应式、流程图等的解决方案，同时，发布人工智能图像识别技术，把图片格式的化学结构，识别为可以重新编辑的结构。


产品特色：
1.完全免费，是人人都用得起的正版科研软件
2.结构式智能识别，解决了重复输入的难题
3.双端通用，能够在网页端绘制结构式，顺应轻量化联合办公的需求
4.兼容良好，兼容office、WPS等常用办公软件，能实现双向通讯，支持cdx、SMILES、mol等常见格式，其Excel插件支持SDF类型文件，实现化学信息学计算。
5.具备ChemDraw里面的结构式优化、质谱核磁图谱预测、TLC绘制、结构和IUPAC名称互相转化等优秀功能。在计算化学方面InDraw也具备Chem3D的一些功能，支持3D结构图形，自由能计算，蛋白相互作用计算等。
6.一键识别：截取图片中的结构式可识别，且支持格式png、tif、tiff、jpg、jpeg、psd
7.InDraw画结构式，直接复制粘贴到word;双击word中的结构式，InDraw官方最新版可以直接在InDraw结构式编辑器中打开;在InDraw中修改，实时更新到 word
3.KingDraw
KingDraw化学结构式编辑器软件由青岛清原精准农业科技有限公司开发研制，是一款专业型化学结构式编辑器。具有手势绘制、结构式美化、3D分子模型转换、化合物命名、IUPAC名称转结构式、结构式搜索、化学属性分析等功能，并且内置多种化学绘图元素和基团，方便用户绘制结构式。KingDraw可兼容cdx、mol、SMILES等多种常用结构式绘制软件的文件格式，并支持ACS1996等绘图标准。可以与Chemdraw等常用结构式软件互通，可以将结构式在两个软件中互相复制粘贴,而且支持将结构式直接复制粘贴到Office系列办公软件中，并可以进行同步修改。


产品特色：
1.完全免费：KingDraw手机版、PC版均可以进行免费下载安装，内置功能全部免费
2.多端同步：KingDraw有App和PC版可供下载。同一个账号可以同步多端信息。
3.格式兼容：KingDraw可兼容cdx、mol、SMILES等多种常用结构式绘制软件的文件格式，并支持ACS1996等绘图标准。
4.可以与Chemdraw等常用结构式软件互通，可以将结构式在两个软件中互相复制粘贴。
5.KingDraw PC版支持可以将结构式在两个软件中互相复制粘贴。而且支持将结构式直接复制粘贴到Office系列办公软件中，并可以进行同步修改。
4.ChemSketch
ACD/ChemSketch是高级化学发展有限公司(ACD)设计的用于化学画图用软件包，该软件包可单独使用或与其他软件共同使用。ChemSketch可用于画化学结构、反应和图形。也可用于设计与化学相关的报告和演讲材料。


主要功能：
1.结构模式：用于画化学结构和计算它们的性质。
2.画图模式：用于文本和图象处理
3.分子性质模式：对以下性质进行估算： *分子量 *百分组成 *摩尔折射率， *摩尔体积 *等张比容 *折射率 *表面张力 *密度 *介电常数 *极性 *单一同位素质量, 标称分子量和平均分子质量
5.ChenDraw
ChemDraw是美国CambridgeSoft公司开发的ChemOffice系列软件中最重要的一员（其它两个组件为Chem3D(分子结构模型)和ChemFinder(化学数据库信息)），是一款专业的化学结构绘制工具，它是为辅助专业学科工作者及相关科技人员的交流活动和研究开发工作而设计的。由于它内嵌了许多国际权威期刊的文件格式，近几年来成为了化学界出版物、稿件、报告、CAI软件等领域绘制结构图的标准。
中文官网：https://www.chemdraw.com.cn/


产品特色：
1.绘制化学结构式及反应图
2.利用软件系统内嵌的基于分子力学的MM2方法，可对分子构型进行动力学模拟
3.利用内嵌的GAMESS量子化学软件包，可对分子构型进行优化
4.可以计算IR、Raman和核磁共振图谱等数据。
5.内嵌许多国际权威期刊的文件格式，可相互调整
6.预测相关化学性质
总结：
1.免费软件：Collector,InDraw,KingDraw,ChemSketch；付费软件：ChemDraw
2.国产软件：Collector,InDraw,KingDraw；非国产软件ChemDraw
3.界面语言：中文：Collector,InDraw,KingDraw,ChemSketch（汉化）；英语：ChemDraw
4.功能性：ChemDraw全面，Collector智能，InDraw,KingDraw,ChemSketch各有所长

感恩由您

为什么要手动绘制绘制化学结构呢，AI助你快速绘制化学结构！
StoneMIND Collector 是一款可以极速提取化学结构的软件，StoneMIND Collector主要提供一键截图、极速识别结构、结构编辑、化学名称一键转结构等功能，用户在Collector简洁的纯中文界面里可快速提取化学分子结构式的各类格式文件，大量节省用户绘制结构时间。


在大家平常科研工作中的数据整理、格式转换、PPT制作、合成研究、结构绘制等应用场景中， Collector是一款能大量节省结构绘制时间并轻松高效获取化学结构信息的实用工具。
与ChemDraw连用：支持识别后结构的sdf格式文件下载及mol/smiles格式的一键复制，可以在chemdraw中打开编辑


极速识别：随时随地轻松提取结构，一次截屏一个结构，一次快速识别操作只需1秒钟！（分子量大且复杂的结构因网速差异识别时间在2-4秒之间）


识别准确度高：对于常规截图的化学分子结构式和常用1000个化学基团名缩写，均可一键识别。Collector对含有多元环、螺环、手性的复杂化学分子结构式均具有非常高的识别准确度。



识别记录追溯和收藏：Collector帮助用户追溯历史识别记录，同时用户可通过收藏功能实现对常用或感兴趣分子的快速复现。
欢迎大家下载安装Collector，我们会持续完善产品的识别功能和优化用户体验。有兴趣的同学可以登录Collector官网【www.stonewise.cn】下载哟~

队长是我

晶体结构试试CrystalMaker；
分子结构的话Marvin，Img2chem，Kingdraw
画化学结构的软件？

同花顺

绘制结构式可以试试KingDraw~
专业且全面的化学绘图软件，并且兼容cdx、mol等常用文件格式。
KingDraw目前有手机端、平板电脑端、电脑端，不同客户端可以通过“云端”存储、共享文件，大家可以根据自己的使用环境进行选择。


KingDraw APP、KingDraw HD

专为移动端用户设计的化学绘图软件，不仅支持多种结构式、反应机理的绘制，还支持化学属性查询、3D模型转换、结构式命名（移动端）、智能手绘、结构式图像识别、化合物百科查询等多种功能。


其中的【化合物百科】模块可以说是KingDraw的一大亮点。化合物百科收录1.5化合物信息，我们在KingDraw中绘制好结构后，轻松一点就可以查看到化合物的详细信息。如果不知道化合物的具体结构式，也可以在化合物百科中进行搜索，一键下载到手机或电脑中。



KingDraw——化合物百科

KingDraw PC端

KingDraw PC端是专为电脑用户设计的化学绘图软件，除了拥有KingDraw APP的全部功能外，还支持与Microsoft Office相关软件的互通，我们通过简单的Ctrl+c、Ctrl+v，就可以把绘图内容复制到Word、PowerPoint等软件中，并且支持双击修改~


KingDraw：如何将结构式复制到Word、PowerPoint等软件中13 赞同 · 4 评论文章13 赞同 · 4 评论文章13 赞同 · 4 评论文章13 赞同 · 4 评论文章13 赞同 · 4 评论文章13 赞同 · 4 评论文章KingDraw：KingDraw与ChemDraw互通升级！Word中的ChemDraw文件也能编辑~33 赞同 · 6 评论文章33 赞同 · 6 评论文章33 赞同 · 6 评论文章34 赞同 · 7 评论文章37 赞同 · 7 评论文章38 赞同 · 10 评论文章有兴趣的同学可以在各大手机应用市场，以及KingDraw官网【http://www.kingdraw.com】下载需要的版本~